Bloggers ponen reacciones químicas a través del molino de replicación


De la revista Nature En su tiempo libre, un equipo de bloggers de química está tratando de replicar los protocolos publicados para fabricar moléculas. Los investigadores desean comprobar lo fácil que es repetir las recetas que los científicos informan en los documentos, y están invitando a otros químicos a unirse a ellos. "

De la revista Nature

En su tiempo libre, un equipo de bloggers de química está tratando de replicar los protocolos publicados para fabricar moléculas. Los investigadores desean comprobar lo fácil que es repetir las recetas que los científicos informan en los documentos, y están invitando a otros químicos a unirse a ellos.

"Solo somos un grupo de personas que quieren hacer que las reacciones funcionen", explica el bloguero See Arr Oh, que reside en los Estados Unidos y prefiere no revelar su nombre real. Los otros miembros del equipo incluyen al estudiante graduado de química Matt Katcher de Princeton, Nueva Jersey, y dos bloggers llamados Organometallica y BRSM, quienes juntos lanzaron Blog Syn, en el cual informan su progreso en línea.

Entre las frustraciones que él y otros han experimentado con la literatura química, dice See Arr Oh, hay afirmaciones de que las reacciones producen productos en cantidades mayores de lo que parece razonable, y escasos detalles sobre las condiciones específicas para ejecutar las reacciones. En algunos casos, se informan reacciones que parecen demasiado buenas para ser verdad, como un artículo de 2009 que fue corregido en 24 horas por químicos expertos en la web que bloguearon el experimento; Un episodio que inspiró parcialmente a Blog Syn. "Nunca olvidé esa reacción", agrega Arr Oh, agrega.

"Pregúntele a cualquier químico sintético en qué pasan la mayor parte de su tiempo, y admitirán que las reacciones de la literatura están funcionando", dice el químico Peter Scott, de la Universidad de Warwick en Coventry, Reino Unido. "Ese es el elefante en la sala de química sintética".

Blog Syn es uno de varios lugares donde los químicos pueden verificar los conocimientos de síntesis. La revista Organic Syntheses, por ejemplo, solo publica procedimientos sintéticos que han sido verificados y verificados por un miembro de su consejo editorial. Scott participa en un proyecto separado para compilar una base de datos de aproximadamente 5, 000 procedimientos químicos, llamada SyntheticPages, que forma parte de ChemSpider, una base de datos en línea de estructuras químicas. Y el Journal of Visualized Experiments (JoVE), una revista en línea revisada por pares que Publica videos de experimentos - lanzará un canal de química el 4 de febrero. Esto podría ayudar con una dificultad que enfrentan algunos químicos: las reacciones químicas publicadas están escritas en un formato estándar que se supone que hace las cosas fáciles de seguir, aunque a menudo se necesitan ajustes no escritos para que los experimentos tengan éxito en la práctica.

See Arr Oh dice que Blog Syn es diferente a JoVE y SyntheticPages porque esas iniciativas involucran a químicos que refinan y verifican sus propias reacciones químicas. Por el contrario, Blog Syn pretende utilizar el servicio público, lo que significa que los forasteros (químicos que los bloggers ya conocen, para empezar) verifican el trabajo que ya ha sido publicado por otros.

Caso de prueba
Hasta ahora, los bloggers han investigado una reacción, que escogieron porque sería especialmente útil si fuera fácil de replicar; utiliza un catalizador de hierro y azufre para hacer moléculas en forma de anillo que contienen oxígeno y nitrógeno. Siguiendo el método publicado, el equipo no pudo obtener tanto del producto final como los autores originales. "Sí funciona, pero aún no estamos seguros de los factores que tienen los autores que nosotros no", dice See Arr Oh. Un problema, dice el blog post del equipo, era que el documento escrito no dejaba en claro cuán rigurosamente necesitaban excluir el aire de la reacción.

Los esfuerzos en línea de los químicos reflejan un enfoque creciente en las ciencias sobre la importancia de poder reproducir los procedimientos publicados. Un proyecto, la Iniciativa de Reproducibilidad, se estableció el año pasado para permitir que los investigadores validen su estudio con verificadores externos. Otro, el Proyecto de Reproducibilidad, está dedicado a estimar la reproducibilidad de los experimentos de psicología. El director de ese proyecto, el psicólogo social Brian Nosek de la Universidad de Virginia en Charlottesville, cree que Blog Syn solo funcionará si se puede recompensar a los químicos por participar.

See Arr Oh acepta que la financiación de Blog Syn será el desafío de desarrollarlo a mayor escala. Él está explorando formas de hacer que el blog sea más fácil de administrar, incluidos los métodos de financiamiento de fuentes múltiples como el sitio web Kickstarter. Hasta entonces, continuará verificando las reacciones en su tiempo libre. "En el momento en que estas reacciones se realizan por la noche al amparo de la oscuridad", dice.

Este artículo se reproduce con permiso de la revista Nature . El artículo fue publicado por primera vez el 21 de enero de 2013.